Hava Tuğgeneral Ender Kartal, Samsun doğumlu olup eğitim hayatına İstanbul’da başladı. Lise öğrenimini 1988 yılında Haydarpaşa Lisesi’nde tamamladıktan sonra Hava Harp Okulu’na giren Kartal, 1992 yılında teğmen rütbesiyle mezun oldu. Aynı yıl 2’nci Ana Jet Üs Komutanlığı’nda uçuş eğitimine başladı, ardından 1993’te Hava Savunma Okulu’nda Uçaksavar Subay Temel Eğitimi’ni aldı ve 1994’te bu eğitimini başarıyla tamamladı.
1994–2001 yılları arasında Hava Teknik Okullar Komutanlığı’nda takım ve bölük komutanlığı gibi çeşitli görevler üstlenen Kartal, 2001–2003 yıllarında 7’nci Ana Jet Üs Komutanlığı’nda bölük komutanı olarak görev yaptı. 2003 yılında Hava Harp Akademisi’ne öğrenci subay olarak katılan Kartal, 2005’te Kurmay Yüzbaşı rütbesiyle mezun oldu.
Görev kariyerinde Genelkurmay Başkanlığı Stratejik Araştırmalar Merkezi, 4’üncü Ana Jet Üs Komutanlığı ve Hava Kuvvetleri Komutanlığı Proje Başkanlığı gibi kritik görevlerde yer aldı. Ayrıca, Silahlı Kuvvetler Akademisi’nde (2009–2010) ve Pakistan Karaçi’deki Hava Harp Akademisi’nde (2010–2011) ileri düzey askeri eğitimler aldı.
2013–2016 yılları arasında Çin’in Pekin kentinde Türkiye’nin Silahlı Kuvvetler Ataşesi olarak görev yapan Kartal, 2016’dan itibaren Milli Savunma Üniversitesi’ne bağlı Hava Astsubay Meslek Yüksekokulu Komutanlığı ve Hava Harp Enstitüsü Müdürlüğü gibi üst düzey eğitim kurumlarında yöneticilik yaptı.
2019 yılında Yüksek Askerî Şûra kararıyla Tuğgeneralliğe terfi etti. Bu rütbeyle Hava Teknik Okullar Komutanlığı (2019–2021) ve MSÜ Hava Harp Enstitüsü Müdürlüğü (2021–2023) görevlerini yürüttü. 11 Ağustos 2023 tarihli Cumhurbaşkanlığı Kararnamesi ile MSÜ Müşterek Harp Enstitüsü Müdürlüğü’ne atandı.
Askeri kariyeri boyunca pek çok görev ve başarı rozeti ile ödüllendirilen Tuğgeneral Ender Kartal; idarî, lojistik, iç güvenlik, eğitim, atış ve kıta komutanlığı alanlarında takdir belgelerine sahiptir.
İngilizce bilen Tuğgeneral Kartal, Ayşegül Kartal ile evlidir.
